Michaela Káčerková vystudovala hru na varhany na Pražské konzervatoři u Jana Hory, dále na Akademii múzických umění v Praze u Jaroslava Tůmy a na Hochschule für Musik und Theater Felix Mendelssohn Bartholdy Leipzig (Prof. Stefan Engels – varhany, Prof. Tobias Schade – cembalo). Během studia se zúčastnila mnoha mistrovských kurzů pod vedením významných pedagogů (Harald Vogel, Martin Sander, Lorenzo Ghielmi, Olivier Latry, Ludger Lohmann) a v roce 2006 se stala laureátkou Mezinárodní varhanní soutěže v Opavě. Věnuje se pravidelné koncertní činnosti a spolupracuje s mnoha sbory, orchestry a barokními ansámbly (Symfonický orchestr Českého rozhlasu, Leipzig Baroque Orchestra, Pražský smíšený sbor, Capella Regia, Art N). Jako sólistka vystoupila na koncertech v České republice i zahraničí. Od roku 2014 je ředitelkou Mezinárodního varhanního festivalu J. C. F. Fischera.